iPhoneを一度に売れる台数に上限はある?

はい。iPhoneの買取数に上限があるお店は多いです。

「同機種○○台まで」「1日△△台まで」だったりお店による設定はマチマチです。
複数台お持ちの場合は事前に確認することをおすすめします。